A endoscopia com biópsia é solicitada quando são encontradas áreas anormais durante o exame e consiste em coletar amostras de tecido retiradas do esôfago, estômago e duodeno que passam por análise anatomopatológica.

Com essa análise feita por um médico patologista, é possível identificar bactérias, inflamações, células cancerígenas ou outras doenças.